نقد و بررسی شبهات مطرح شده در داستان خلقت حضرت آدم در کتاب دکتر سها با نام کتاب نقد قرآن، موضوع پژوهش حاضر می‌باشد. در طول این داستان سه شبهه کلیدی مطرح شده است. شبهه اول با عنوان تناقض خلقت حضرت آدم با نظریه داروین می‌باشد که نتیجه حاصل شده از نقد و بررسی این شبهه مبین این مطلب است که نظریه داروین هنوز در حد یک نظریه است و تقریر‌های گوناگونی از منظر دانشمندان زیست شناسی و اندیشمندان اسلامی بر آن وارد است. شبهه دوم با عنوان عدم برتری انسان بر فرشتگان در این پژوهش به رشته تحریر در آمده است که خلاصه نتیجه بدست آمده نشان می‌دهد سبب برتری انسان بر فرشتگان تعلیم اسماء از جانب پرودگار نبوده است بلکه تفاوت در ظرفیت‌های وجودی ملائک و انسان سبب این برتری و علم الأسماء شده است. شبهه سوم مربوط به عدم خطاکار بودن شیطان می‌باشد که در بررسی و نقد این شبهه می‌توان گفت امتناع شیطان از فرمان الهی به دلیل تکبر و خودپسندی شیطان می‌بوده و پاسخ موضوعاتی همچون خلقت شیطان، امهال شیطان و وسوسه‌های شیطانی همگی در جایگاه حکمت و عدل الهی قابل پاسخ است.