با توجه به احساس ضرورت برای دفاع از حریم نورانی قرآن کریم و پاسخگویی به شبهاتی که بر محور این کتاب آسمانی شکل گرفته، موضوع پایان نامه انتخاب شد، تا ضمن ارائه تحقیقی علمی – پژوهشی، موضوعی کاربردی که مورد نیاز امروز جامعه دینی باشد نیز به سامان برسد. هدف این جستار، شناسائی و بررسی اشکالات و ایراداتی است که از سوی مستشکلان در ذهن و قلب جوانان ما ایجاد شبهه می کند، می باشد. پس از پرداختن به تعاریف و کلیات (فصل اول) شبهات مطروحه در سه فصل جداگانه، بیان و نقد و بررسی شده و به آنها پاسخ داده شده است. در فصل دوم، شبهاتی آورده شده که پیرامون مسأله موانع عدالت می باشد و سپس به هریک از شبهات پاسخی مقتضی و لازم داده شده است و آن شبهات عبارتند از:
1- وجود نظام طبقاتی در قرآن
2- امر به تقدیرگرائی در قرآن
3- سلب حق حکومت مسلمانان بر خودشان.
در فصل سوم، شبهاتی آورده شده که پیرامون مسئله موانع آزادی می باشد و سپس به هریک از شبهات پاسخی مقتضی و لازم داده شده است و آن شبهات عبارتند از:
1- نفی آزادی عقیده
2- ممنوعیت نقد احکام و معارف دین.
در فصل چهارم، شبهاتی آورده شده که پیرامون موانع پیشرفت می باشد و سپس به هریک از شبهات پاسخی مقتضی و لازم داده شده است و آن شبهات عبارتند از:
1- بی ارزش بودن دنیا
2- عدم توجه اسلام به علوم تجربی
3- خارج کردن زنان از عرصه اجتماع.